Identification and structural characterization of chondroitin sulfate disaccharides in human biglycan by nanoelectrospray ionization-ion mobility tandem mass spectrometry

Sarbu Mirela; Ica Raluca; Biricioiu Roxana; Clemmer David E.; Zamfir Alina D.: Identification and structural characterization of chondroitin sulfate disaccharides in human biglycan by nanoelectrospray ionization-ion mobility tandem mass spectrometry.

[thumbnail of proceedings_of_isaep_2024_223-224.pdf]
Előnézet
Cikk, tanulmány, mű
proceedings_of_isaep_2024_223-224.pdf

Letöltés (179kB) | Előnézet

Absztrakt (kivonat)

We have implemented a superior glycomics method based on ion mobility separation (IMS) mass spectrometry (MS) and tandem MS (MS/MS) to characterize the chondoritin sulfate (CS) disaccharide domains in human biglycan (BGN). The high separation efficiency and sensitivity of IMS MS technique allowed the discrimination of five distinct CS motifs, of which four irregulated in their sulfation pattern. The structural investigation by IMS MS/MS disclosed that in one or both of the CS/DS chains, the non-reducing end is 3-O-sulfated GlcA in a rare bisulfated motif having the structure 3-O-sulfated -GlcA-4-O-sulfated GalNAc. Considering the role played by BGN in cancer cell spreading, the influence on this process of the newly identified sequences is to be investigated in the future.

Mű típusa: Konferencia vagy workshop anyag
Befoglaló folyóirat/kiadvány címe: Proceedings of the International Symposium on Analytical and Environmental Problems
Dátum: 2024
Kötet: 30
ISBN: 978-963-688-009-5
Oldalak: pp. 223-224
Nyelv: angol
Kiadó: University of Szeged
Kiadás helye: Szeged
Konferencia neve: 30th International Symposium on Analytical and Environmental Problems
Konferencia típusa: Konferencia
Helyszin: Szeged
Dátum: 2024. október 7-8.
Befoglaló mű URL: https://acta.bibl.u-szeged.hu/85607/
Kulcsszavak: Biokémia, Tömegspektrometria
Megjegyzések: Bibliogr.: 224. p. ; összefoglalás angol nyelven
Szakterület: 01. Természettudományok
01. Természettudományok > 01.04. Kémiai tudományok
Feltöltés dátuma: 2024. nov. 25. 08:55
Utolsó módosítás: 2024. nov. 25. 08:55
URI: http://acta.bibl.u-szeged.hu/id/eprint/85719
Bővebben:
Tétel nézet Tétel nézet